Boldenoni voidaan muuttaa estrogeeniksi, mutta vähemmän kuin testosteroni, lisäksi boldenoni metaboloituu 1,4-dienedioniksi, joka on voimakas aromataasin estäjä.Boldenoni muuntaa 5-alfa-reduktaasin 1-testosteroniksi, tehokkaammaksi steroidiksi sekä 5-beeta-isomeeriksi, jonka uskotaan olevan inaktiivinen metaboliitti.Sitoutuminen SHBG:hen on paljon heikompaa boldenonilla kuin testosteronilla, mikä tarkoittaa suurempaa vapaan plasman pitoisuutta, mutta lyhyempää puoliintumisaikaa plasmassa.On vain vähän tai ei ollenkaan sitoutumista progesteroni- tai glukokortikoidireseptoreihin eikä todellista tietoa boldenonin vuorovaikutuksesta eri entsyymijärjestelmien kanssa.

Boldenoni toimii samalla tavalla kuin methandrostenoloni, ja sillä on vähemmän haitallisia androgeenisiä vaikutuksia.Sillä on erittäin pitkä puoliintumisaika, ja se voi näkyä steroidikokeessa jopa 5 kuukauden ajan, koska pitkä undekylenaattiesteri on kiinnittynyt emosteroidiin.Lääkkeen pieniä määriä voidaan helposti havaita kuukausien ajan käytön lopettamisen jälkeen.

Vaikka boldenonista yleensä verrataan nandroloniin, siitä puuttuu progesteronireseptorivuorovaikutus ja kaikki siihen liittyvät progestogeeniset sivuvaikutukset.